由于生化培养箱的使用方式，污垢和细菌会残留下来。如果不消毒，下一次使用中难免会出现错误，甚至有实验失败的可能。该设备常用于环境保护、卫生防疫、药检、农畜、水产品、科研、高校、生产部门、水质分析及生化需氧量测定、细菌、霉菌、微生物、栽培、保鲜、植物栽培、养殖实验等。
生化培养箱的消毒方法比较简单，不同的使用者采用不同的消毒方法：
1、先用75%酒精擦拭内壁，再用甲醛高锰酸钾熏蒸一晚，打开紫外线灯通风一周。
2、先用75%酒精擦拭内壁，通风10分钟，紫外线照射30分钟。
3、用70%乙醇擦洗，再用0.1%神经酰胺擦洗，再用高锰酸钾和甲醛按1:1的比例擦洗。
4、平时注意清洁周围环境。使用后，先用纯水擦洗，再用95%酒精擦洗，再用紫外线照射。
这样，使用后对生化培养箱进行清洗消毒，保证再次使用时清洁无污染。
